En las refinerías de Barrancabermeja y Cartagena se transforman en productos de valor agregado los crudos que llegan de los campos. El 2018 se alcanzó una carga de 372,9 miles de barriles en las refinerías; la más alta en la historia. La carga de la refinería de Barrancabermeja fue de 221,6 Kbdc, superior en 11,7 Kbdc a la de 2017; la de la Refinería de Cartagena fue de 151,3 Kbdc que, comparado con 2017, representa un incremento de 11,5%.
La refinería de Barrancabermeja alcanzó un rendimiento en destilados medios de 37,0%vol. La refinería de Cartagena obtuvo un rendimiento de destilados medios de 56,1% vol, lo que representa un incremento de 14% respecto al rendimiento del año anterior; e incrementó la dieta de crudos nacionales, pasando de 66%vol a principios del año a 82%vol en diciembre.
En la refinería de Barrancabermeja el margen bruto de refinación disminuyó de US$13,5/barril en 2017 a US$11,8/barril en 2018. En la refinería de Cartagena el margen se incrementó de US$9,5/barril en 2017 a US$11,0/barril en 2018.
La refinería de Barrancabermeja invirtió en el año 2018 US$136 millones. Dentro de dicho plan se realizaron mantenimientos por US$106 millones y reposiciones y mejoramientos por US$30 millones. La Refinería de Cartagena invirtió en el año 2018 US$56 millones.